Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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USP25Q9UHP3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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USP25Q9UHP3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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USP25Q9UHP3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP25Q9UHP3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP25Q9UHP3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP25Q9UHP3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP25Q9UHP3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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