Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL42Q9P2K6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL42Q9P2K6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms