Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRBP1Q9P2E9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRBP1Q9P2E9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms