Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FBXO28Q9NVF7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO28Q9NVF7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms