Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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TDP1Q9NUW8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDP1Q9NUW8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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