Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms