Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms