Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms