Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2J2Q9GZM3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms