Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP44Q9C0F1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms