Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM5Q9C035 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms