Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms