Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CITED1Q99966 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CITED1Q99966 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CITED1Q99966 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CITED1Q99966 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CITED1Q99966 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CITED1Q99966 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CITED1Q99966 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CITED1Q99966 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CITED1Q99966 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms