Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms