Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC43Q96MW1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms