Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX22Q96L94 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms