Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM5Q96DZ9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms