Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC11Q96DB2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms