Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD50Q92878 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms