Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NEDD1Q8NHV4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms