Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FSIP1Q8NA03 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FSIP1Q8NA03 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms