Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD163Q86VB7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms