Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms