Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIAT1Q6ZQX7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms