Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASC1Q6TDU7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms