Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOA5Q6Q788 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms