Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC137Q6PK04 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms