Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SDE2Q6IQ49 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SDE2Q6IQ49 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms