Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LINC01545Q5VT33 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LINC01545Q5VT33 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LINC01545Q5VT33 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LINC01545Q5VT33 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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LINC01545Q5VT33 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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LINC01545Q5VT33 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC01545Q5VT33 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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