Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MARCH8Q5T0T0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MARCH8Q5T0T0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MARCH8Q5T0T0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MARCH8Q5T0T0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MARCH8Q5T0T0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MARCH8Q5T0T0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MARCH8Q5T0T0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MARCH8Q5T0T0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MARCH8Q5T0T0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms