Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COLEC12Q5KU26 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms