Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms