Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TYSND1Q2T9J0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms