Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC142Q17RM4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC142Q17RM4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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