Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6V1FQ16864 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6V1FQ16864 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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