Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA4Q16363 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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