Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP13Q15645 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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