Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDK3Q15120 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms