Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
HERC3Q15034 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERC3Q15034 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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