Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB39AQ14964 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms