Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VGLL4Q14135 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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