Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RUNX2Q13950 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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