Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
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