Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL3Q13618 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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