Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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