Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1H3Q13133 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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NR1H3Q13133 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1H3Q13133 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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