Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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RESTQ13127 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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RESTQ13127 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RESTQ13127 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RESTQ13127 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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RESTQ13127 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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RESTQ13127 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RESTQ13127 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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