Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LCP2Q13094 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LCP2Q13094 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LCP2Q13094 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LCP2Q13094 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LCP2Q13094 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms