Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCB1Q12824 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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