Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIPPLY1Q0D2K3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIPPLY1Q0D2K3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms